プライマーの設計に関する問題　高校生物発展

【 note : https://note.com/yaguchihappy 】 プライマーの設計に関する問題について解説します。 ●ちなみに、プライマーが短すぎると、色々な場所に結合してしまうので、余計な増幅産物ができてしまう。今回の動画は考え方を示すものである。実際、今回の動画のように４塩基しかない短いプライマーを使ってしまうと、様々な副産物が生じてきてしまう（GCCGなんて配列はDNA上のいたるところに出現するので）。ただ、長いプライマーは高価であるし、DNAと結合する確率が減り、産物の収量が下がる（プライマーのサイズが大きいほどアニーリング効率は低下する）。さらに、プライマー同士結合（アニーリング）しないようにするなど、他にも様々な考慮すべき条件があるが、大学で学べばよい。 ●生体内ではRNAでできたプライマーが使われる（すぐに破壊され、DNAに置き換えられる。「ここから鎖の伸長を始めた」という目印になっていると考えられている）。PCRではDNAでできたプライマーが使われる。 ※申し訳ありません。3´や５´のダッシュ（プライム）「´」が、アポストロフィー「’」の形になっています。正しくはダッシュ（プライム）「´」です。ただし、あまり厳密な書き分けのルールはなく、「´」を「’」と表記することもあります。たとえば東北大学２０１５入試問題第２問、高校生物教科書（東京書籍　東書・生物301）、『ベーシックマスター分子生物学改訂２版』（オーム社）、『現代化学史』（京都大学学術出版会）、『遺伝子・染色体検査学』（医歯薬出版株式会社）、『バイオ実験イラストレイテッド②遺伝子解析の基礎』（秀潤社）ｐ５０、『イラストレイテッド　ハーパー・生化学』（丸善）ｐ４２５など。 #生物 #PCR #プライマー